با هدف تسهیل، شفاف‌سازی و استانداردسازی فرآیندهای پژوهشی، پایگاه توسعه تحقیقات بالینی بیمارستان امیرالمومنین (ع) مجموعه‌ای از روندهای اجرایی را تدوین و در دسترس پژوهشگران قرار داده است. این روندها شامل مراحل کامل تصویب پروپوزال، انجام مطالعات بالینی، دریافت مشاوره‌های پژوهشی و آماری، پیگیری امور کمیته اخلاق، اجرای طرح، نگارش گزارش نهایی و انتشار نتایج پژوهش است. ارائه این روندها به پژوهشگران کمک می‌کند تا با آگاهی دقیق از مراحل اداری، علمی و اجرایی، فعالیت‌های تحقیقاتی خود را با سرعت، دقت و کیفیت بالاتر پیش ببرند. پژوهشگران می‌توانند در این بخش با ترتیب مراحل، مدارک مورد نیاز، زمان‌بندی‌ها و مسئولین هر مرحله آشنا شده و فرآیند پژوهشی خود را به‌صورت منظم و اصولی دنبال نمایند.