مرکز تحقیقات سل و بیماریهای عفونی کودکان با هدف گسترش آموزش و پژوهش و تحقیقات کاربری به منظور ارتقاء سطح علمی و کنترل بیماریهای سل و بیماریهای عفونی کودکان و سل مقاوم به درمان، دستیابی به آخرین یافته ها و نوآوریها و هماهنگی و همکاری منطقه ای و بین المللی در زمینه های مزبور همچنین ارائه روشهای پیشرفته در بکارگیری و استفاده از آن در امر تحقیقات کاربردی تاسیس شده است.
این مرکز به عنوان جزیی از نظام تحقیقات کشور و در چهار چوب سیاست‌های پژوهشی با استعانت از خداوند متعال مأموریت‌هایی را در زمینه‌های رفع نیازهای بهداشتی، ارتقاء سطح سلامت جامعه، افزایش میزان تحقیقات کاربردی، بالابردن سطح علمی و افزایش روحیه پژوهشگری در کادر آموزشی و دانشجویان، عهده دارد و در سال 1389 به استناد رای شورای گسترش دانشگاههای علوم پزشکی ، با ابلاغ مقام محترم وزارت و با دریافت مجوز اصولی، بطور رسمی فعالیتهای پژوهشی خود را آغاز نموده است.
عنوان این مرکز در خرداد ماه 1394 به " مرکز تحقیقات بیماری های عفونی" تغییر یافت و در تاریخ 6/5/1394 موفق به کسب مجوز قطعی گردید